Симптомы заболевания вызывают как сами микробы, так и выделяемые ими токсины. В самом начале заболевания человека беспокоит слабость, вялость, снижение аппетита, головная боль, повышение температуры, ощущение усталости. Через некоторое время возникает тошнота и рвота, появляются схваткообразные боли в животе, понос с примесью слизи, гноя или крови (например, при дизентерии). Может беспокоить жажда и озноб. Кишечные инфекции могут протекать в виде острого гастрита (с рвотой и болями под ложечкой), энтерита (с поносом), гастроэнтерита (с рвотой и поносом), колита (с кровью в экскрементах и нарушением стула), энтероколита (с поражением всего кишечника). Кроме того, получают широкое распространение кишечные инфекции, которые прежде не диагностировались или встречались редко (ротавирусный гастроэнтерит, клебсиеллез и др.).
Одно из самых опасных последствий, возникающих при кишечных инфекциях — обезвоживание организма вследствие рвоты или поноса. Особенно тяжело эти болезни протекают в раннем детском возрасте и у пожилых людей. Результатом резкого обезвоживания могут стать почечная недостаточность и другие тяжелые осложнения, в частности, дегидратационный шок. Поэтому при появлении симптомов, напоминающих острую кишечную инфекцию, необходимо срочно обратиться за медицинской помощью.