Возникновение рефлюкса может быть симптомом проявления грыжи пищеводного отверстия диафрагмальной перегородки, когда в отверстие попадает часть желудка, которого в норме там не должно быть.
Часто пациенты не обращают внимания на изжогу или отрыжку, поэтому рефлюкс-эзофагит, особенно тяжелый, обычно обнаруживают, когда болезнь уже приняла характер хронического заболевания. И хотя у большинства пациентов с эрозивным эзофагитом (эзофагит, сопровождающийся появлением эрозий на слизистой оболочке пищевода) после адекватной терапии наступает улучшение, почти у 80% больных после прекращения лечения, часто в первые 3 месяца, наступает рецидив заболевания.
В 8-20% случаев у пациентов с эзофагитом развиваются стриктуры пищевода, а в 5% - язвы.
Если рефлюкс-эзофагит существует длительное время, возможно изменение (перерождение) клеток слизистой оболочки пищевода по типу метаплазии или дисплазии (пищевод Баррета). При отсутствии лечения в дальнейшем может развиться злокачественная опухоль (рак пищевода).